病理诊断是疾病诊断的金标准。北京大学第一医院病理科最重要的职责和任务是承担北京大学第一医院各种手术标本的病理学诊断，目前组织学年外检量逾40,000例，非妇科细胞学近6,000例，分子病理学诊断逾1500例且每年快速递增中，并常年接受来自全国各地的各种疑难病例的病理会诊。病理诊断除了疾病定性分类外，根据目前医疗诊治模式的发展还有各种外科标本评估、多种与疾病预后和治疗相关的分子活性或变化情况评估等。规范和高质量的病理诊断及病理技术是我科的特色，也将我科病理学诊断工作推向高水平。病理诊断的深入发展产生了数个强项优势的亚专科病理学及其队伍，尤其是淋巴造血系统病理学领域，经过多年实践积累大量淋巴瘤病理学诊断经验及科学研究成果，具有国内一流的诊断水平及独到见解。其他强项亚专科还包括乳腺疾病病理学、妇科病理学、分子病理学等，均在国内享有较高声誉。